Kudela är anklagad för att ha uttryckt sig rasistiskt mot Rangersspelaren Glen Kamara när lagen möttes i Europa League-åttondelen.
Uefa säger i ett uttalande att utredningen mot Kudela är inledd och att han därför är avstängd i torsdagens match. Uefa säger också att mer information om fallet kommer när man nått ett slutgiltigt beslut.
Slavia Prag å sin sida anmälde Kamara för att ha misshandlat Kudela i spelartunneln. Även den utredningen pågår.
Det stod tidigare klart att Kudela skulle missa matchen mot Arsenal sedan Slavia Prag meddelat att han är sjuk och fått en smäll på näsan.
Rasismanklagelsen utreds även av skotsk polis och Glen Kamaras advokat sade i mars att tjecken troligen skulle bli förhörd om han återvände till de brittiska öarna.
Kudela medverkade dock när Tjeckien ställdes mot Wales i Cardiff utan några polisiära ingripanden.