Presidenten skriver på Truth Social att insatsen pausas för att ge bästa möjliga förutsättningar för att nå en slutlig fredsöverenskommelse med Iran.
Beslutet har enligt Trump fattats efter påtryckningar från bland annat medlarlandet Pakistan och för att ”stora framsteg mot en fullständig och slutgiltig överenskommelse” gjorts.
Blockaden mot iranska hamnar ligger kvar.
Insatsen, som fått namnet ”Project freedom”, startade under måndagen. Syftet har varit att bistå närmare 23 000 sjömän från 87 olika länder som varit instängda i Gulfen i mer än två månader, sade USA:s utrikesminister Marco Rubio under tisdagskvällen.
Strax efter Trumps besked kom rapporter från statliga iranska medier om att Irans utrikesminister Abbas Araghchi landat i Peking för samtal med sin kinesiske motpart Wang Yi.
USA har tidigare uppmanat Kina att sätta press på Iran kring ett fredsavtal.
Även Marco Rubio har den senaste veckan haft ett möte med Wang Yi och Donald Trump reser om en vecka till Peking för att träffa president Xi Jinping.
