Macrons uttalande under onsdagen är riktat mot militärjuntan som i slutet av juli utförde en kupp och fängslade den folkvalde presidenten Mohamed Bazoum.
Kuppen har fördömts av stora delar av världssamfundet, bland annat av EU och den Afrikanska unionen.
Enligt Macron stoppar militärjuntan matleveranser från att nå fram till den franska ambassadbyggnaden, och att den franska personalen tilldelas militärransoner. Han säger också att personalen inte tillåts att lämna ambassaden.
– De hålls bokstavligen som gisslan, säger Emmanuel Macron enligt flera internationella medier.