Hon blir därmed den 13:e skådespelaren och den första kvinnan att ta sig an huvudrollen i kanalens science fiction-serie. Det har länge spekulerats i om rollfiguren kommer att gestaltas av en kvinna härnäst och namn som Tilda Swinton, Olivia Colman och Phoebe Waller-Bridge har varit på tapeten, men även Whittaker.
"Jag är mer än peppad på att starta denna episka resa med Chris (Chris Chibnall seriens manusförfattare) och alla "Whovian" i världen. Det är en stor ära att få spela Doktorn", säger Whittaker till BBC.
Aktrisen har tidigare synts i "Broadchurch", "Black sea" och "Attack the block".
Jodie Whittaker tar över efter Peter Capaldi som i en intervju med BBC Radio i januari meddelade att han skulle lämna serien.
"Det är dags att gå vidare. Det känns sorligt, jag älskar Dr Who, det är ett fantastiskt program att jobba med", sa han då.
Capaldi har spelat vetenskapshjälten sedan 2013 men gör sina sista scener i en julspecial i slutet av året. Det är även då som Whittaker debuterar.