City inleder hemma på Etihad Stadium på tisdagskvällen dubbelmötet mot Monaco i åttondelsfinalen – och troligen med Agüero i startelvan.
Anfallaren, länge en pålitlig målskytt och frontfigur i City, har haft en ovanligt blek säsong.
Sedan november har han blott lyckats peta in två bollar och förlorade sin plats till Gabriel Jesus, 19-åringen som i vintras värvades från Palmeiras. Jesus slog omgående igenom med dunder och brak, bara för att bryta ett mellanfotsben och missa resten av säsongen.
Fortsatt förtroende
Guardiola öppnade på nytt dörren för Agüero, men argentinaren gjorde en tam insats i helgens mållösa möte med Huddersfield i FA-cupen.
Inför matchen mot Monaco fick Guardiola inte oväntat frågor om Agüero. På presskonferensen gjorde Guardiola klart att hans förtroende för 28-åringen är orubbat och de har ett gott förhållande.
Mot Monaco saknas mittbacken Vincent Kompany. Knappast idealiskt mot ett motstånd av den kaliber som väntar i åttondelsfinalen.
Imponerad av Monaco
Monegaskerna har bombat in 76 mål i franska ligan hittills den här säsongen, fler än något annat lag i de europeiska toppligorna.
- Jag är verkligen imponerad över hur bra de är. De är fysiskt starka. Deras ytterbackar spelar som yttrar, deras yttermittfältare som offensiva mittfältare. Deras två anfallare (Radamel Falcao och Valère Germain) har killerinstinkt i straffområdet, säger Pep Guardiola.
Falcao har fått ett lyft under managern Leonardo Jardim. 31-åringen, som haft en skadefylld karriär, matchas varsamt.
- Jag hanterar honom annorlunda än övriga. Jag sade inför säsongen att jag var säker på att han skulle lyckas. Kvalitet är bestående och han är en spelare av hög klass, säger Jardim.
Hittills har Falcao gjort 22 mål på 28 matcher för Monaco.
I tisdagskvällen andra åttondelsfinal tar Bayer Leverkusen emot Atlético Madrid.
Fakta: Så spelas Champions League
14 februari: Paris SG–Barcelona 4–0, Benfica–Dortmund 1–0.
15 februari: Bayern München–Arsenal 5–1, Real Madrid–Napoli 3–1.
21 februari: Leverkusen–Atlético Madrid, Manchester City–Monaco.
22 februari: Porto–Juventus, Sevilla–Leicester.
Returmatcherna i åttondelsfinalerna spelas 7–8 mars och 14–15 mars.
17 mars lottas kvartsfinalerna.
11–12 april och 18–19 april avgörs kvartsfinalerna.
21 april lottas semifinalerna.
2–3 maj och 9–10 maj avgörs semifinalerna.
3 juni spelas finalen i Cardiff, Wales.
Fakta: Monaco målfarligast i toppligorna
Klubbarna från Europas toppligor (England, Spanien, Tyskland, Frankrike och Italien) som gjort flest mål den här säsongen:
1) Monaco 76 mål (26 matcher i Frankrike).
2) Barcelona 63 mål (23 matcher i Spanien).
3) Napoli 60 mål (25 matcher i Italien).
4) Arsenal och Liverpool 54 mål (25 matcher i England).
5) Bayern München 46 mål (21 matcher i Tyskland).