Alberto Bettiol befann sig ensam i täten och lyckades cykla förbi demonstranterna.
Därefter blev han ombedd att stanna. Detsamma hände även för resterande cyklister.
Efter att demonstranterna avlägsnats från vägen av fransk polis återupptogs loppet igen med de tidsskillnader som gällde när loppet avbröts.
Enligt webbplatsen Cyclingnews demonstrerade gruppen för att uppmärksamma klimatförändringarna.
Magnus Cort, från Danmark, tog till slut hem etappen före australiern Nick Schultz efter en tät spurtstrid som krävde målfoto.