Enligt Gabons försvarsminister Etienne Massard är de skadade en man och en kvinna.
Jens Henneberg, biträdande direktör på Bonnier Publications som står bakom den danska utgåvan av National Geographic, säger att det rör sig om ett par i 40-årsåldern som rest till Gabon för att fotografera flodhästar och gorillor.
- De har anknytning till National Geographic. Det är två frilansfotografer, berättar han för Ritzau.
Nyhetsbyrån AFP rapporterar att de två arbetar för National Geographics tv-kanaler, och befann sig på en marknad i staden när de anfölls av en knivbeväpnad man.
- Enligt de första vittnesmålen ropade gärningsmannen, en 53-årig nigerier, "Allahu akbar" (Gud är större), säger Gabons försvarsminister Etienne Massard.
Nigeriern, som nu sitter gripen, uppges sedan ha förklarat att dådet var en hämnd för "USA:s attacker mot muslimer".
Polisen i Gabon har hämtat in flera personer för förhör med anledning av händelsen, rapporterar AFP.