Olyckan med den tragiska utgången skedde vid Skallahamn utanför Onsalahalvön på måndagen.
Larmet om det fanns en person i vattnet kom strax efter klockan 14 från flera personer.
– Vi har ett stort pådrag med Sjöräddningen och dykare från räddningstjänsten, säger Gunilla Jensen vid SOS Alarm.
Enligt Sjö- och flygräddningscentralen ska privatpersoner ha sett hur kajaken gick omkull.
– Jag tror att de och möjligtvis med räddningstjänstens hjälp tog sig ut och kunde få upp den här personen, säger Fredrik Persson vid Sjö- och flygräddningscentralen.
Personen, en man, fördes enligt SOS Alarm med ambulans till sjukhus efter olyckan.
Hans liv stod dock inte att rädda.
Vid 16.45-tiden meddelade Sahlgrenskas pressjour att mannen, som är i 35-årsåldern, har avlidit.
Anhöriga har underrättats.