Polisen har utrett Temer som anklagas för att ha tagit mutor för att påverka nya regler för landets hamnar.
Temer, som tog över då den förra presidenten Dilma Rousseff ställdes inför riksrätt, har upprepade gånger uppgett att han är oskyldig. Han är immun från att åtalas så länge han sitter på presidentposten, om högsta domstolen inte beslutar att ta ifrån honom immuniteten.
Luís Roberto Barroso, domare i Högsta domstolen, säger att han vill vänta in vad åklagarna kommit fram till innan han beslutar hur han ska gå vidare.
Enligt polisen bör även Temers dotter Maristela, hans tidigare rådgivare Rodrigo Rocha Loures och åtta andra nära medarbetare delges misstanke och få sina tillgångar konfiskerade för sina roller i vad polisen anser är penningtvätt av mutpengar.
Temers kansli har inte kommenterat uppgifterna. Hans presidentperiod går ut den 1 januari, och då förlorar han sin immunitet.
Kongressen röstade två gånger förra året för att sätta stopp för att Temer skulle kunna ställas inför rätta i Högsta domstolen i tre korruptionsmål.