En gärningsman till fots sprängde en bomb nära huvudingången till högkvarteret samtidigt som människor var på väg till sina arbeten på morgonen. Sex personer i en bil blev dödade.
– Sex civila dödades och tre andra skadades, säger Najib Danish, talesperson för inrikesdepartementet.
Bilen träffades när den passerade området.
Terrorgruppen IS tar på sig ansvaret för attacken, enligt dess propagandaorgan Amaq.
För en vecka sedan tog IS på sig en attack mot en träningsanläggning i Kabul tillhörande samma underrättelseorganisation.
Det dådet hejdades då säkerhetsstyrkor gick till motattack och dödade angriparna. Ingen annan kom till skada den gången.