- Tidigare var det bara en lokal terroristgrupp. Men nu har de har anslutit sig till IS ideologi. De vill göra Mindanao till en del av kalifatet, säger Jose Calida, motsvarande justitiekansler.
Calida säger att det numera inte rör sig om ett uppror bland filippinier, utan en "invasion av utländska terrorister", som väljer Filippinerna om de har svårt att ta sig till Irak eller Syrien.
"Kan lösas"
Sex utlänningar har dödats enligt en företrädare för armén, bland dem personer från Indonesien och Malaysia.
I onsdags utfärdade president Duterte undantagstillstånd i landets sydligare delar sedan strider brutit ut med militanta extremister som svurit trohet till terrorrörelsen IS. Attackhelikoptrar, granateld och specialstyrkor har satts in i staden Marawi, och huvuddelen av stadens runt 200000 invånare rapporteras ha flytt.
I ett tal säger Duterte, som rest till ön, att striderna är ett tecken på att IS är närvarande i Filippinerna. Han säger sig dock vara villig att samtala med extremisterna.
- Mitt budskap, främst riktat till terroristerna på andra sidan, är att vi fortfarande kan lösa det här genom dialog, säger han.
Mer än 40 döda
Filippinska myndigheter uppgav på torsdagen att elva soldater, två poliser och 31 extremister dödats i striderna.
Duterte sade att en polis halshuggits då han stoppades av extremister vid en vägspärr. Polismannen har dock sagt att han lever och mår bra, enligt nyhetsbyråer.
Bakgrund: Strider i Marawi
Striderna bröt ut på onsdagen i Marawi på Mindanao när den filippinska armén försökte ringa in beväpnade män ur den islamistiska Maute-milisen, som i sin tur flytt från en misslyckad räd i tisdags mot ledaren för den islamistiska Abu Sayyaf-milisen. Maute-krigarna tog kontroll över flera av stadens gator, byggnader och broar, och tände eld på ett fängelse, en skola och en kyrka.
President Rodrigo Duterte avbröt ett statsbesök i Ryssland och utlyste undantagstillstånd på ön.
Både Maute och Abu Sayyaf har svurit trohet till Islamiska staten. Abu Sayyaf har gjort sig känd för att kidnappa utlänningar och utkräva stora lösensummor.