Det Moskvabaserade företaget anses var känsligt för Kremls inflytande. Att använda deras antivirusprogram skulle kunna äventyra den nationella säkerheten, enligt USA:s departement för inrikes säkerhet (DHS).
Beslut kommer som ett svar på vad amerikanska underrättelsetjänster har beskrivit som ett hot mot den nationella säkerheten från ryska nätaktörer. Ryska hackare har pekats ut för inblandning i fjolårets valrörelse i USA.
Kaspersky Lab avvisar anklagelserna.
"Inga trovärdiga bevis har presenterats offentligt av någon person eller organisation då anklagelserna är baserade på falska påståenden och felaktiga antaganden", säger företaget i ett uttalande.
Beslutet gäller endast civila myndigheter och inte Pentagon, men amerikanska underrättelsetjänstemän sade tidigare i år att Kaspersky Labs produkter vanligtvis inte är tillåtet på militära nätverk.