Aktien sjönk drygt två procent i efterhandeln på New York-börsen.
Apple sålde 45,5 miljoner telefoner under fjärde kvartalet som slutade den 24 september, vilket var 800000 fler än analytiker i genomsnitt hade räknat med. Men det var ändå tredje kvartalet i rad med vikande försäljning. Bolaget sålde drygt 48 miljoner Iphone under samma period ett år tidigare.
Kvartalsvinsten föll 19 procent till 9 miljarder dollar.
Apples försäljningsprognos för innevarande kvartal ligger mellan 76 och 78 miljarder dollar. Bedömare hade räknat med en försäljning på drygt 75 miljarder dollar.
Omsättningen för det senaste kvartalet sjönk med 9 procent till 46,9 miljarder dollar, vilket var ungefär i linje med analytikernas förväntningar.
De senaste modellerna, Iphone 7 och Iphone 7 plus, lanserades två veckor innan delårsrapporten för det fjärde kvartalet avslutades.